「Trp64Arg」「rs4994」とは?多型の表記の読み方
2026年10月7日
文責: dNAXY neo 編集部(担当ペルソナ: 佐々木 英樹)
rs で始まる番号は、多型ごとに付けられた登録番号です。Trp64Arg は、たんぱく質の64番目のアミノ酸がトリプトファン(Trp)からアルギニン(Arg)に変わる多型を表します。
UCP1 の -3826A>G は、遺伝子の始まりから3826塩基手前の塩基が、A(アデニン)から G(グアニン)に変わる多型です。論文やデータベースでは、同じ多型が別の書き方で出てくることもあります。
1つの多型に、いくつもの書き方がある
米国国立生物工学情報センター(NCBI)のデータベース dbSNP で rs4994 を開くと、ADRB3 の Trp64Arg が次のような書き方で並んでいます。
| 書き方 |
何を基準にした位置か |
| rs4994 |
dbSNP の登録番号 |
| Trp64Arg |
たんぱく質のアミノ酸の番号(論文でよく使う名前) |
| p.Trp64Arg |
たんぱく質の並び(国際的な表記の決まりに沿った形) |
| c.190T>C |
たんぱく質の作り方が書かれた部分の、190番目の塩基 |
| g.37966280A>G |
8番染色体の、端から数えた位置 |
dNAXY neo の「検査結果の根拠」のページに並べているのは、多型の名前(Trp64Arg)と rs 番号(rs4994)です。名前は論文での呼び方、rs 番号はデータベースで探すための番号です。
rs 番号は dbSNP の登録番号
NCBI の説明では、rs は「Reference SNP」を縮めた書き方とされています。研究者が報告した個人差のうち、ゲノムの同じ場所にある同じ種類の違いを1つにまとめ、その場所に rs 番号を付けています。
| 遺伝子 |
多型の名前 |
rs 番号 |
結果レポートの項目 |
| ADRB3 |
Trp64Arg |
rs4994 |
糖質 |
| UCP1 |
-3826A>G |
rs1800592 |
脂質 |
| ADRB2 |
Arg16Gly |
rs1042713 |
たんぱく質(筋肉) |
論文によって多型の名前の書き方が違っても、rs 番号が同じなら同じ場所です。ほかの検査の説明と見比べるときは、まず rs 番号を確かめてください。
アミノ酸は3文字か1文字で書く
Trp64Arg の Trp と Arg は、アミノ酸の名前を3文字に縮めたものです。1文字で書く決まりもあり、Trp64Arg は W64R とも書かれます。
| アミノ酸 |
3文字 |
1文字 |
| トリプトファン |
Trp |
W |
| アルギニン |
Arg |
R |
| グリシン |
Gly |
G |
遺伝子の個人差の書き方を決めている国際的な表記の決まり(HGVS の勧告)は、3文字の書き方を勧めています。1文字の書き方では頭文字が重なるアミノ酸があり、取り違えが多いためです。たとえば1文字の G はグリシンですが、塩基の G はグアニンを指します。
先頭の c. と p. と g.
HGVS の勧告では、位置の前に付ける文字が、どの並びを基準に数えたかの印です。
| 先頭 |
基準にする並び |
ADRB3 の例 |
| g. |
ゲノム(染色体)の並び |
g.37966280A>G |
| c. |
たんぱく質の作り方が書かれた部分の並び |
c.190T>C |
| p. |
たんぱく質のアミノ酸の並び |
p.Trp64Arg |
アミノ酸1つは塩基3つで決まります。64番目のアミノ酸の1つ目の塩基は、63×3+1で190番目です。c.190 と p.64 は、同じ違いを塩基とアミノ酸のそれぞれで数えた番号になります。
論文とデータベースで文字が違って見える理由
rs4994 の dbSNP の表示は A と G、論文や dNAXY neo の結果レポートでは T と C です。どちらも同じ違いを指しています。
DNA は2本の鎖が向かい合った形で、A は T と、G は C と組になっています。ADRB3 は、ゲノムの基準の向きとは逆の鎖に書かれた遺伝子です。そのため、ゲノムの向きで読むと A と G、遺伝子の向きで読むと T と C になります。UCP1 の rs1800592 も同じで、dbSNP の表示は T と C、遺伝子の向きの名前は -3826A>G です。
もう1つ、名前の順番と基準の並びが合わないこともあります。ADRB2 の多型は論文で Arg16Gly と呼ばれてきました。今の NCBI の基準の並びでは、16番目のアミノ酸を Gly としているため、dbSNP の表記は p.Gly16Arg です。基準の並びの以前の版では、同じ場所が Arg でした。名前の前後のどちらが多いか、どちらが肥満と関連するかは、名前の順番だけでは決まりません。
同じ遺伝子でも、場所が違えば別の多型
遺伝子の名前が同じでも、番号が違えば別の多型です。根拠のページに載せた日本人男性210人の研究(Hayakawa ら、2000年)は、ADRB2 の Arg16Gly と Gln27Glu の2つを調べました。Gln27Glu は、27番目のアミノ酸がグルタミン(Gln)からグルタミン酸(Glu)に変わる多型です。この研究では、どちらの多型にも肥満との関連は見られませんでした。検査ごとに読む場所が違う話は「遺伝子検査の結果が会社によって違うのはなぜ?呼び方と調べる遺伝子」にまとめています。
結果レポートの「遺伝子検査について」の章は、組み合わせを ADRB3 で T/T、T/C、C/C、UCP1 と ADRB2 で A/A、A/G、G/G と書いています。項目ごとの危険度1〜3を決めるのは、肥満に関連するとされる並びの数です。
3つの多型を調べるには
dNAXY neo の検査は、綿棒で頬の内側をこすって送る方式です。検体の到着から約2週間で、3つの項目の危険度が結果レポートに載ります。価格は9,350円(税込・送料込み)です。結果が出た日から30日間は、遺伝子タイプに合わせた1週間の献立と食事の判定を使えます。結果レポートの一例は「結果レポートのサンプル」で見られます。
出典
文責
dNAXY neo 編集部(株式会社tatepass)

担当ペルソナ: 佐々木 英樹(遺伝子検査)
遺伝子と遺伝子検査の記事を担当します。検査でわかることとわからないことを分けて、根拠の研究とあわせて説明します。
担当ペルソナについて
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